Lloji i lidhjes amide që ndodh gjatë formimit të proteinave peptide pas ndërveprimeve të dy aminoacideve, kjo është përgjigja e pyetjes se çfarë është një lidhje peptide.
Nga një palë aminoacide, shfaqet një dipeptid, domethënë një zinxhir i këtyre aminoacideve, plus një molekulë uji. Sipas të njëjtit sistem, zinxhirët më të gjatë krijohen nga aminoacidet në ribozome, domethënë polipeptidet dhe proteinat.
Veçoritë e zinxhirit
Aminocide të ndryshme, të cilat janë një lloj "materiali ndërtues" për proteinat, kanë një R radikal.
Si me çdo amide, lidhja peptide e proteinës së zinxhirit C-N, me anë të ndërveprimit të strukturave kanonike midis karbonit karbonil dhe atomit të azotit, zakonisht ka një veti të dyfishtë. Kjo zakonisht gjen shprehje në reduktimin e gjatësisë së saj në 1,33 angstroms.
E gjithë kjo çon në përfundimet e mëposhtme:
- C, H, O dhe N - 4 atome të lidhura, plus 2 a-karbone janë të vendosura në të njëjtin rrafsh. Grupet R të aminoacideve dhehidrogjenet a-karbon janë tashmë jashtë kësaj zone.
- H dhe O në lidhjen peptide të aminoacideve dhe a-karbonet e çiftit të aminoacideve janë të orientuara trans, megjithëse trans-izomeri është më i qëndrueshëm. Në L-aminoacidet, grupet R janë gjithashtu të orientuara nga trans, i cili është i pranishëm në të gjitha peptidet dhe proteinat në natyrë.
- Rrotullimi rreth zinxhirit C-N është i vështirë, rrotullimi në lidhjen C-C ka më shumë gjasa.
Për të kuptuar se çfarë është lidhja peptide, si dhe për të zbuluar vetë peptidet me proteina dhe për të përcaktuar sasinë e tyre në një tretësirë të caktuar, përdorni reaksionin biure.
Rregullimet e atomeve
Lidhja në peptidet proteinike është më e shkurtër se në grupet e tjera peptide, pasi ka një karakteristikë të pjesshme të lidhjes së dyfishtë. Duke marrë parasysh se çfarë është një lidhje peptide, mund të konkludojmë se lëvizshmëria e saj është e ulët.
Ndërtimi elektronik i lidhjes peptide përcakton strukturën e ngurtë planare të një grupi peptidesh. Planet e grupeve të tilla janë të vendosura në një kënd me njëri-tjetrin. Lidhja midis atomit a-karbon dhe grupeve a-karboksil dhe a-amino mund të rrotullohet lirshëm përgjatë boshtit të tij, ndërkohë që është i kufizuar në madhësi dhe natyrën e radikalëve, dhe kjo bën të mundur që zinxhiri polipeptid të vendoset në vetvete të ndryshme. cilësimet.
Lidhjet peptide në proteina, si rregull, janë në konfigurim trans, domethënë, rregullimi i atomeve a-karbon ndodhet në pjesë të ndryshme të grupit. Rezultati është vendndodhja e radikaleve anësore në aminoacide në një distancë më të largët në hapësirë nga njëri-tjetri.mik.
Kyerja e proteinave
Kur studiohet se çfarë është një lidhje peptide, zakonisht merret parasysh forca e saj. Zinxhirë të tillë nuk thyhen vetë në kushte normale brenda qelizës. Kjo do të thotë, në një temperaturë të përshtatshme të trupit dhe një mjedis neutral.
Në kushte laboratorike, hidroliza e zinxhirëve peptidikë proteinikë studiohet në ampula të mbyllura, brenda të cilave ka acid klorhidrik të përqendruar, në një temperaturë mbi njëqind e pesë gradë Celsius. Hidroliza e plotë e proteinave në aminoacide të lira ndodh në rreth 24 orë.
Në pyetjen se çfarë është një lidhje peptide brenda organizmave të gjallë, atëherë prishja e tyre ndodh me pjesëmarrjen e disa enzimave proteolitike. Për të gjetur peptide dhe proteina në një tretësirë, si dhe për të zbuluar sasinë e tyre, ata përdorin rezultatin pozitiv të substancave që përmbajnë dy ose më shumë lidhje peptide, pra reaksionin biure.
Zëvendësimi i aminoacideve
Brenda hemoglobinës S anormale, 2 zinxhirë β u mutuan, në të cilat glutamati, si dhe një aminoacid shumë polar i ngarkuar negativisht në pozicionin e gjashtë, u zëvendësuan me një valinë hidrofobike që përmban radikal.
Brenda hemoglobinës së mutuar është një rajon që është komplementar me një rajon tjetër me të njëjtat molekula që përmban aminoacidin e ndryshuar. Në fund të fundit, molekulat e hemoglobinës "mbërthyen së bashku" dhe formuan agregate të gjata fibrilare që ndryshojnë qelizën e kuqe të gjakut dhe çojnë në shfaqjen e një qelize të kuqe të gjakut të mutuar në formë gjysmëhënës.
Brenda oksihemoglobinës S, si rezultat i një ndryshimi në konformacionin e proteinave, maskohet një vend plotësues. Mungesa e aksesit në të e bën të pamundur lidhjen e molekulave me njëra-tjetrën në këtë oksihemoglobinë. Ekzistojnë kushte të favorshme për formimin e agregateve të HbS. Ato rrisin akumulimet e deoksihemoglobinës brenda qelizave. Këto mund të përfshijnë:
- hipoksi;
- kushtet alpine;
- punë fizike;
- fluturim me aeroplan.
Anemia me qeliza drapër
Meqenëse eritrocitet në formë drapëri kanë përshkueshmëri të ulët përmes kapilarëve të indeve, ato mund të bllokojnë enët e gjakut dhe kështu të krijojnë hipoksi lokale. Kjo do të rrisë akumulimin e deoksihemoglobinës S brenda qelizave të kuqe të gjakut, si dhe shkallën me të cilën shfaqen agregatet e hemoglobinës S dhe do të krijojë edhe më shumë kushte për deformimin e qelizave të kuqe të gjakut.
Sëmundja drapërocitare është një sëmundje homozigote recesive që shfaqet vetëm kur të dy prindërit kalojnë një palë gjenesh të mutuara të zinxhirit β. Pas lindjes së foshnjës, sëmundja nuk shfaqet derisa sasi të mëdha të HbF të kthehen në HbS. Pacientët shfaqin simptoma klinike që janë karakteristike për aneminë, d.m.th.: dhimbje koke dhe marramendje, palpitacione, gulçim, dobësi ndaj infeksioneve etj.
